Microsoft søgte i 1998 og fik i 2000 et patent med titlen ”Method and computer program product for automatically generating an Internet Protocol (IP) address”. De er nu under kritik af Public Patent Foundation (PUBPAT), som gerne ser patentsystemet ændret. De mener, at patentet ligner IPv6 meget.
Fra Daniel Ravicher fra PUBPAT lyder det, at man ikke forventer, at Microsoft vil følge op på sine rettigheder til patentet, men måske vil dets eksistens gøre, at nogle firmaer ikke vil bruge IPv6. Man mener, at det er endnu et eksempel på, hvordan patenter kan ødelægge eller hæmme standarder.
Ravicher påstår, at det amerikanske patentkontor ikke blev underrettet om et “betydeligt antal” prior art referencer, bl.a. dokumenter fra IPv6-komiteen i IETF, da Microsoft søgte om patentet og at de ansatte fra Microsoft, der stod som opfindere af patentet, også var en del af IPv6-komiteen. Idet Microsoft angiveligt ikke har oplyst om prior art referencerne, er det muligt, at patentet ikke skal håndhæves.
David Kaefer fra Microsoft udtaler, at man er ved at kigge på PUBPATs beskyldninger.